Проблемы при загрузке файлов. Загруженные файлы не работают на моей системе, и имеют заголовок в первой строке Content-Type.

Если у Вас стоит RedHat 7.0 и Вы обновили PHP RPM до php-4.0.4pl1-3.i386.rpm, то в этом случае эта проблема связана не с phpMyAdmin, а с RedHat 7.0. Дело в том, что данный пакет имеет серьезную ошибку, которая была давным-давно исправлена в PHP.
Проблема усугубляется еще тем, что сбойный пакет все еще доступен, хотя данный баг был исправлен. Поэтому если у Вас возникает даная проблема, то для её решения загрузите исправленный пакет. Данное действие решит также \r\n проблему загружаемого файла!

Источник: гениальное народное творчество